La copertura, che nelle navate laterali è a spiovente, nella navata centrale è data da tre tiburi uguali a base quadrata sovrastati da piramidi a chiancarelle; queste ultime sono il risultato di un restauro eseguito negli anni '60 in cui si è tenuto conto delle tracce rinvenute dallo Jonescu sotto le tre terrazze piane che allora coprivano la navata centrale.